农工党在黑龙江的发展是从1983年12月成立农工党齐齐哈尔市中央直属小组开始的，1985年1月成立农工党中央直属齐齐哈尔市支部委员会，1986年3月成立农工党中央直属哈尔滨医科大学支部委员会，1986年5月两个支部合并改名为农工党中央直属黑龙江省支部委员会。1988年7月28-30日召开农工党黑龙江省第一次代表大会，选举产生农工党黑龙江省第一届委员会。

截至2023年6月，共建立哈尔滨、齐齐哈尔、牡丹江、佳木斯、大庆、大兴安岭6个市（地）级组织和159个基层组织。农工党黑龙江省委会机关设办公室（社会服务部）、组织部、宣传部、参政议政部四个职能部门。